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恢复出厂设置后，手机中的短信通常会丢失。因为恢复出厂设置意味着手机中的所有数据被清除，包括存储的短信、联系人、应用程序等。因此，如果进行了此操作，那么短信将不再可用。建议在恢复出厂设置之前备份重要数据，以避免数据丢失。

仅供参考，建议咨询手机品牌客服获取准确的答案，同时请注意，操作前务必谨慎考虑，以免丢失重要信息。